La Facultad de Medicina es la más antigua de todas las facultades médicas de Bialystok. Se inauguró al mismo tiempo que la Academia de Doctores de Bialystok, en virtud de las clases de seminario en el Hospital Universitario, mediante el Reglamento del Consejo de Ministros del 3 de febrero de 1950; sin embargo, hasta 2004 no comienza el programa de formación médica de 6 años en inglés.
Los recursos de investigación y enseñanza de la Facultad continuaron creciendo y avanzando a lo largo de los años, con la contratación de nuevos profesores y la construcción de nuevos departamentos y clínicas.
La Facultad ofrece enseñanza, investigación, diagnóstico y tratamiento de pacientes a través de sus 69 unidades de organización, que incluyen 26 departamentos, 40 clínicas, 2 centros de estudio y 2 laboratorios independientes.